文书档案案卷整理规则是收集齐全，分类准确，归档完整，排列有序，科学保管，便于查阅利用。文书档案案卷的整理还必须要遵循文件形成的自然规律，保持文件之间的历史联系，因为档案是历史的真实记录，如果不遵循文件之间的历史联系，也就失去了档案的真实意义。

　　文书档案的整理工作主要包括分类、立卷、排列和编目。

　　(1)分类。分类的一般方法是按照文件材料产生的时间或来源、内容、形式等进行分类。

　　(2)立卷。立卷的主要依据是文件材料的问题特征、时间特征、名称特征、作者特征、通信特征和地区特征。

　　(3)排列案卷排列较为常用的方法是依据其所反映的工作上的联系或问题进行排列。

　　(4)编目。编目的类型基本有两种，一种是综合目录，一种是分册目录。分册目录又可按类别或保管期限来编制。